公眾諮詢 / 彙集意見
自初步設計階段起，港鐵公司一直與地區保持緊密聯系，聽取居民對鐵路的意見。因應地區的關注，港鐵公司就鐵路方案作出多項修訂，務求建造一條能切合社區需要的鐵路。
東華三院賽馬會復康中心
高架橋結構將盡量遠離復康中心A座至不少於18米
鄰近復康中心A座的一段高架橋將加設隔音罩
高架橋隔音罩的頂部將調整至與復康中心A座地下平台相若
鋼綫灣臨時躉船轉運站
臨時躉船轉運站的運作時間已縮短，並減少運泥車的行走數量
運泥車將經域多利道及沙灣徑前往臨時躉船轉運站，並從數碼港道離開，不會途經區內學校
港鐵公司會在有需要時進行道路改善措施
聖神修院
減少因南港島綫(東段)工程而需被收回的土地範圍
利東站
利東站的體積已縮細，以減低對附近居民的影響
海怡半島站
原建議設於海怡東商場入口附近的升降機將會遷移到巴士總站附近，以便更有效服務居民
縮小怡南路的通風設施及機房大樓的體積，設計將會與附近環境融合
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